9月20日电 据台媒报道，台湾进口蛋风波愈演愈烈，台当局农业部门负责人陈吉仲19日晚间宣布决定请辞。台行政部门称，尊重陈吉仲的决定，勉予准辞，并于21日生效。陈吉仲成为台湾“最短命”的农业部门负责人，上任仅50天。
据报道，近来台湾进口蛋争议不断，延烧近半个月却仍无法止血，外界纷将矛头指向陈吉仲，17日一度传出陈吉仲请辞获准，随后台行政部门表示，陈吉仲曾口头向台行政部门负责人陈建仁请辞，但获慰留。如今陈吉仲再次请辞获准，陈建仁指派台农业部门“政务次长”陈骏季暂代“部长”一职，并要求他持续进行社会沟通说明，厘清各界疑虑。
台湾资深媒体人蒋德纲投书媒体指出，陈吉仲把“蛋蛋危机”搞成“食安风暴”＋“图利厂商弊疑案”，简直是超级强烈“台风”。陈吉仲处理巴西进口蛋荒腔走板，超思公司何方神圣说不清楚、金流合约兜不拢、问题蛋标示出错、流向不明，还有数量庞大必须销毁做堆肥，中秋节将届，烘焙业者人心惶惶，种种迹象导向人谋不臧的可能性愈来愈明显。
台湾“中时新闻网”发文分析称，陈吉仲的去留，绿营内部有两派势力在争斗。一派认为陈若此时去职，无异承认政策出问题，火将向上延烧到高层；另一派则认为陈引发的巴西进口蛋事件已难收拾，应尽速去职，才不致波及到赖清德的选情。无论如何，这两种想法考虑的都只是民进党的利益，而非全民的利益。消费者最担心的是，这些过期或者不新鲜的巴西进口蛋，会不会混充本土鸡蛋，在市面上以散装方式或加工后出售，甚至早已吃下肚。还有，此次进口巴西蛋的超思公司，以一人公司拿下政府大单，还让陈吉仲护航，背后是否涉及更大的不法利益？是否有业者长期进口即期蛋供作食品加工使用，成为健康的隐形杀手？这些才是民众关注的焦点。
分析指出，台行政部门担心火烧到陈建仁身上，要陈吉仲留下来挡火，但陈吉仲之前为了圆“没有进口禽流感疫区鸡蛋”的谎，已制造太多“有效期限”的谎，一个不被信任的农业部门负责人，又要如何消除民众的疑虑？尽管陈吉仲已经道歉，但在野党的批判没有停止，陈吉仲二度请辞，为舒缓民进党内派系斗争，或许这才是陈吉仲下台的原因。